Этиология заболевания недостаточно выяснена. Связи с какими-либо инфекционными заболеваниями в случае первичного синдрома Шегрена не отмечено.

О наличии предрасположенности к синдрому Шегрена говорит тот факт, что у людей, страдающих данным заболеванием, значительно чаще встречаются следующие антигены гистосовместимости:

• HLA-B8
• HLA-DRw3
• HLA-DRw52
• HLA-DR4
• MT-2